В новом исследовании, опубликованном в журнале Nature Immunology, ученые создали первый детальный клеточный атлас иммунных клеток и кишечных бактерий толстого кишечника человека.
Исследователи изучили 3 различных области здоровой толстой кишки доноров, одновременно анализируя иммунные клетки и бактериальный микробиом из каждой области.
Результаты исследования выявили различные иммунные ниши, показывающие изменения в бактериальном микробиоме и иммунных клетках в толстой кишке. Ученые обнаружили взаимодействие между микробиомом и иммунными клетками организма. Секвенируя активные гены 41000 отдельных иммунных клеток, ученые смогли идентифицировать гены, специфичные для типа клеток, которые были включены в разные популяции иммунных клеток в каждой локации. Ученые также определили бактерии, присутствующие в той же области толстой кишки, чтобы показать, как взаимодействуют иммунная система и бактерии.
Уникальный метод позволил создать первую углубленную карту иммунных клеток и соседних бактерий в здоровом кишечнике человека и помог обнаружить, что в кишечнике есть отчетливые иммунные ниши с различными состояниями активации клеток в разных областях. Результаты исследования показали, что не только имелись различия между иммунными клетками в разных отделах толстой кишки, но и то, что микробиом также изменился, с более широким разнообразием бактерий, расположенных дальше по толстой кишке. Впервые это исследование показало, что регуляторные иммунные клетки, которые ослабляют иммунный ответ, перемещаются из лимфатических узлов в толстую кишку.
Авторы другого исследования заявили, что в борьбе с инфекциями кишечника нервная система играет ключевую роль.