В новом исследовании, опубликованном в журнале Nature Communications, ученые из Немецкого центра исследования инфекций (German Center for Infection Research) обнаружили глобальное распространение штаммов мультирезистентной бактерии, которая может вызывать тяжелые инфекции – Stenotrophomonas maltophilia.
Исследование предоставляет систематическое понимание глобальной филогении штаммов S. maltophilia и показывает способы эффективного мониторинга возбудителя с использованием системы геномной классификации.
Штаммы S. maltophilia встречаются в нескольких природных и связанных с человеком экосистемах. Бактерия долгое время считалась относительно безвредной, но в настоящее время S. maltophilia является одним из самых опасных внутрибольничных патогенов, вызывая инфекции и оставаясь устойчивой к ряду антибиотиков. Это может быть особенно опасно для пациентов с ослабленным иммунитетом или для пациентов с основными воспалительными заболеваниями легких, такими как муковисцидоз. Хотя может быть поражен практически любой орган, наиболее распространены инфекции дыхательных путей, бактериемия или катетер-ассоциированные инфекции кровотока. Ввиду растущей важности этого патогена и тяжелых клинических последствий инфекции, знания о факторах вирулентности о локальной и глобальной передаче бактерий S. maltophilia крайне необходимы.
Ученые из восьми стран первоначально разработали метод генотипирования, который позволяет проводить стандартизированный анализ различных геномов штаммов S. maltophilia. Ученые обнаружили, что комплекс S. maltophilia можно разделить на 23 линии с различными уровнями распространенности. Одна конкретная линия происхождения появилась во всем мире и имела самый высокий уровень связанных с человеком штаммов. Этот штамм Sm6 также характеризовался наличием ключевых генов вирулентности и генов устойчивости. Это говорит о том, что конкретная конфигурация гена может способствовать распространению различных подтипов S. maltophilia в условиях больницы, то есть при антимикробном лечении.
Анализ передачи также выявил несколько потенциальных вспышек генетически близких штаммов, которые были выделены в течение нескольких дней или недель в тех же больницах. Результаты исследования показывают, как систематический мониторинг S. maltophilia и других патогенных микроорганизмов в условиях больниц на основе генома может помочь обнаружить пути передачи инфекции и улучшить инфекционный контроль.
Авторы другого исследования заявили, что борьба организма с грибковой инфекцией изменяется в присутствии вируса.
