В новом исследовании, опубликованном в журнале Cell Research, ученые из Университета Южной Флориды (University of South Florida) работают над определением нескольких существующих соединений, которые блокируют репликацию вируса SARS-CoV-2 в клетках человека, выращенных в лаборатории. Все ингибиторы продемонстрировали сильные химические и структурные взаимодействия с вирусным белком, критическим для способности вируса размножаться.
В новом исследовании ученые визуализировали с помощью трехмерного компьютерного моделирования 3 конфигурации активных сайтов, где ингибитор GC-376 связывается с основной протеазой вируса COVID-19 (препарат-мишень Mpro). Наиболее многообещающие лекарственные препараты, в том числе одобренный FDA препарат против гепатита С боцепревир, а также исследуемый ветеринарный антивирусный препарат, известный как GC-376, нацелены на основную протеазу SARS-CoV-2 – Mpro. Без Mpro вирус не может размножаться и заражать новые клетки. Этот фермент уже был утвержден в качестве мишени противовирусного препарата для лечения SARS и MERS, генетически сходных вирусов с SARS-CoV-2. По словам авторов исследования, Mpro представляет собой привлекательную цель для разработки лекарственных препаратов против COVID-19 из-за важной роли фермента в жизненном цикле коронавируса и отсутствия аналогичной протеазы у людей. Поскольку у людей нет фермента, ингибиторы, нацеленные на этот белок, с меньшей вероятностью вызовут побочные эффекты.
Визуализация трехмерного взаимодействия между противовирусными соединениями и вирусным белком обеспечивает более четкое понимание того, как комплекс Mpro работает и в долгосрочной перспективе может привести к созданию новых препаратов против COVID-19.
Авторы другого исследования утверждают, что мутации SARS-CoV-2 не увеличивают проницаемость.