Сотрудники Вашингтонского университета (Washington University) утверждают, что геймеры, майнеры, работающие с биткойнами, и крупные и малые компании объединились для беспрецедентных усилий по сбору данных о коронавирусе. Целью корпорации является использование незанятых вычислительных мощностей для ускорения исследований в области лечения коронавируса.
Проект, возглавляемый биологами, эффективно создал самый мощный в мире суперкомпьютер, который может обрабатывать триллионы вычислений, необходимых для понимания структуры вируса. Более 400 000 пользователей загрузили приложение за последние две недели из проекта Folding @ Home, по словам директора Грега Боумана (Greg Bowman), сотрудника биохимии и молекулярной биофизики в Вашингтонском университете в Сент-Луисе, где и основан проект.
Усилия по «распределенным вычислениям» объединяют тысячи устройств для создания виртуального суперкомпьютера.
Проект, начатый в Стэнфордском университете (Stanford University ) 20 лет назад, был разработан для использования вычислительной мощности краудсорсинга для моделирования, чтобы лучше понять болезни, особенно аномалии сворачивания белка, которые могут привести к гибели патогенных микроорганизмов.
«Моделирование позволяет нам наблюдать за тем, как движется каждый атом во времени», — объясняет Боуман. «Массивный анализ ищет «карманы» или отверстия в вирусе, в которые можно внедрить лекарственный препарат».
Цели для лекарственных препаратов
Мощные вычислительные усилия могут проверить потенциальную лекарственную терапию, методику, известную как компьютерная разработка лекарственных препаратов. Боуман комментирует, что он с оптимизмом смотрит на эти усилия, потому что ученые ранее нашли лекарственную мишень в вирусе Эбола и потому, что COVID-19 структурно похож на вирус SARS, который был предметом многих исследований. Скорее всего, предметом исследования будут противомалярийные препараты хлорохин и гидроксихлорохин, которые могут быть «перенаправлены» для лечения COVID-19. По словам Боумана, проект смог увеличить свою мощность примерно до 400 петафлопов, причем каждый петафлоп способен выполнять один квадриллион вычислений в секунду, или в 3 раза мощнее, чем ведущие суперкомпьютеры мира.
Другие суперкомпьютеры также работают параллельно. Ранее Национальная лаборатория Ок-Риджа (Oak Ridge National Laboratory) заявила, что, используя самый мощный суперкомпьютер IBM, она обнаружила 77 потенциальных соединений, которые могут связываться с основным «остроконечным» белком коронавируса, чтобы обезвредить патоген. Проект Folding @ Home поддерживается мощными вычислительными ресурсами настольных компьютеров, ноутбуков и даже консолей PlayStation, а также более мощными бизнес-компьютерами и серверами. Любой, у кого относительно новый компьютер, может внести свой вклад, установив