Революционные эпигенетические часы CheekAge: точный прогноз риска смертности
Исследователи разработали новые эпигенетические часы под названием CheekAge, позволяющие точно предсказывать риск смертности с использованием образцов клеток щеки. По данным Medical Insider, в отличие от предыдущих часов, основанных на образцах крови, CheekAge неинвазивен и фиксирует закономерности метилирования, связанные со старением и продолжительностью жизни.
Увеличение риска смертности
В недавнем исследовании, проведённом с участием более 1500 человек, CheekAge показало увеличение риска смертности на 21% при каждом увеличении стандартного отклонения в предсказании возраста часами. Этот новый инструмент может обеспечить простой и эффективный способ мониторинга старения и потенциально помочь отслеживать возрастные заболевания.
Индивидуальное старение
Мы не все стареем с одинаковой скоростью. Хотя некоторые долгожители могут стареть исключительно медленно благодаря генетическому везению, множество поведенческих факторов и факторов образа жизни ускоряют старение, включая стресс, плохой сон, плохое питание, курение и алкоголь. Поскольку такие воздействия окружающей среды запечатлеваются в нашем геноме в виде эпигенетических меток, можно количественно оценить молекулярное старение, охарактеризовав эпигеном в прогностических геномных участках.
Эпигенетические часы
За последнее десятилетие учёные разработали несколько таких «эпигенетических часов», откалиброванных по хронологическому возрасту и различным факторам образа жизни большого числа людей. Большинство из них были сосредоточены на метилировании ДНК в клетках крови, что делало сбор образцов обременительным и вызывало стресс у пациента. Но ранее в этом году учёные из США разработали часы второго поколения под названием CheekAge, которые основаны на данных о метилировании в клетках, которые легко собрать из щёк.
Обучение CheekAge
CheekAge был разработан или «обучен» путём корреляции доли метилирования примерно в 200 000 сайтов с общим показателем здоровья и образа жизни, отражающим предполагаемые различия в физиологическом старении. В настоящем исследовании Шохирев и его коллеги использовали статистическое программирование, чтобы увидеть, насколько хорошо оно предсказывает смертность от любой причины у 1513 женщин и мужчин, родившихся в 1921 и 1936 годах, за которыми на протяжении всей жизни следила программа Lothian Birth Cohorts (LBC) Эдинбургского университета.
Продольное исследование
Результаты исследования показали, что CheekAge в значительной степени связан со смертностью в продольном наборе данных и превосходит часы первого поколения, обученные на наборах данных, содержащих данные крови. В частности, при каждом увеличении CheekAge на одно стандартное отклонение коэффициент риска смертности от всех причин увеличивался на 21%. Это означает, что CheekAge тесно связан с риском смертности среди пожилых людей.
Общие сигналы смертности
Тот факт, что наши эпигенетические часы, настроенные на клетки щеки, предсказывают смертность при измерении метилома в клетках крови, предполагает наличие общих сигналов смертности во всех тканях. Это означает, что простой, неинвазивный мазок из щеки может стать ценной альтернативой для изучения и отслеживания биологии старения.
Гены, связанные со смертностью
Исследователи более подробно рассмотрели те сайты метилирования, которые наиболее тесно связаны со смертностью. Гены, расположенные вокруг или рядом с этими участками, являются потенциальными кандидатами на влияние на продолжительность жизни или риск возрастных заболеваний. Например, ген PDZRN4, возможный супрессор опухоли, и ALPK2, ген, участвующий в развитии рака и здоровья сердца на животных моделях. Другие выделяющиеся гены ранее были вовлечены в развитие рака, остеопороза, воспаления и метаболического синдрома.
Будущие исследования
Будущие исследования также необходимы, чтобы определить, какие ещё ассоциации, помимо смертности от всех причин, можно выявить с помощью CheekAge. Например, другие возможные ассоциации могут включать заболеваемость различными возрастными заболеваниями или продолжительность «продолжительности здоровья», период здоровой жизни без возрастных хронических заболеваний и инвалидности.
Литература.
“CheekAge, a next-generation epigenetic buccal clock, is predictive of mortality in human blood” by Maxim Shokhirev et al. Frontiers in Aging
