В новом исследовании, опубликованном в журнале Nature Communications, ученые изучили, как динамика кишечных бактерий может влиять на успех трансплантации фекальной микробиоты в лечении заболеваний, вызванных Clostridioides difficile.
Актуальность проблемы
Clostridioides difficile является распространенным патогеном, который колонизирует нарушенную микробиоту кишечника. Трансплантация фекальной микробиоты (ТФМ), при которой стул от здорового донора трансплантируется в толстый кишечник реципиента, является успешным методом лечения рецидивирующей инфекции, вызванной C. Difficile.
В новом исследовании ученые представляют алгоритм для разработки персонализированных пробиотических коктейлей для пациентов с C. Difficile в микробиоме кишечника. C. difficile передается через фекально-оральный путь и встречается во всем мире. Хотя C. difficile обычно не колонизирует здоровую ободочную кишку, эта бактерия может беспрепятственно расти в кишечнике, микробиом которого был нарушен антибиотиками. C. difficile не реагирует на стандартные антибиотики и поэтому может рецидивировать у пациентов, увеличивая риск каждый раз. В исследовании показано, что ТФМ излечивает около 80% случаев C. difficile, которые не реагируют на антибиотики.
Теоретическая модель помогла ученым предсказать, какие факторы определяют эффективность ТФМ. Исследователи обнаружили, что эффективность ТФМ уменьшается с увеличением видового разнообразия кишечного микробиома инфицированного человека. Ученые также разработали алгоритм оптимизации для разработки персонализированного пробиотического коктейля для пациентов с C. difficile. Алгоритм основан на экологической теории, которая разрабатывает коктейль с минимальным количеством видов бактерий, сохраняя при этом сложную экологическую сеть видов. Персонализированные пробиотические коктейли содержат виды, которые являются эффективными ингибиторами C. difficile и могут вводиться пациентам с C. difficile для восстановления микробиоты кишечника.
Авторы другого исследования утверждают, что микробиом кишечника может изменить кетогенная диета.
