В новом исследовании, опубликованном в журнале Cancer Cell, ученые из Института Броуда (Broad Institute) обнаружили происхождение молекулярной структуры нормальных и раковых тканей.
Опираясь на данные из Атласа генома рака (TCGA) с участием 10 678 пациентов и 33 типов рака, исследователи обнаружили, что происхождение было связано с вариациями сотен генов, но что наиболее важные из этих различий были связаны с конкретными типами тканей.
Ученые обнаружили, что у пациентов от разных предков молекулярные особенности, соответствующие этим различиям, были в значительной степени ограничены конкретными органами и типами тканей.
Среди конкретных данных исследователей:
- С молекулярной точки зрения, люди африканского происхождения, как правило, имеют другой тип рака почки, чем люди европейского происхождения. Африканский вид рака отличается мутациями, которые отключают ген VHL, стимулируя рост новых кровеносных сосудов опухолей.
- При раке мочевого пузыря у людей из стран Восточной Азии наблюдается меньше признаков возникновения реакции иммунной системы, чем при опухолях мочевого пузыря у людей европейского происхождения.
В исследовании ученые использовали различные молекулярные методы, чтобы определить происхождение пациентов, чьи образцы ткани были проанализированы. Пациенты были классифицированы как имеющие в основном европейское, восточноазиатское, африканское, латиноамериканское или южноазиатское происхождение. Пациенты, чье происхождение было смешанным по крайней мере на 20%, были классифицированы как имеющие смешанное происхождение.
Ученые провели глубокий анализ тканей каждого пациента, анализируя раковые и нормальные клетки на наличие ряда молекулярных особенностей. Они включали мутации (неправильно скопированные участки ДНК); паттерны метилирования ДНК (процесс, который влияет на включение или выключение генов); мессенджер РНК (молекула, которая несет транскрибированную версию ДНК и указывает на активность гена); и микроРНК (форма РНК, которая способствует или препятствует активности генов).
Ученые обнаружили, что различия, связанные с предками, охватывают все эти признаки и присутствуют в сотнях различных генов. Оказалось, однако, что наиболее существенные различия – те, которые влияют на то, как клетки функционируют и взаимодействуют с остальным телом – были глубоко тканеспецифичными. Хотя происхождение влияло на молекулярные особенности у большинства типов рака, эти эффекты не были общими для всех типов рака. Молекулярные различия в раке легких, которые были прослежены, например, для африканского происхождения, не были обнаружены при раке молочной железы, поджелудочной железы или других раковых опухолях. Исследователям еще предстоит определить, являются ли молекулярные различия между предками результатом факторов окружающей среды или генетических факторов. Тем не менее, ученые выявили генетические различия между предками, которые могли бы объяснить многие из их результатов.
Авторы другого исследования заявили, что в лечении рака молочной железы поможет уничтожение «спящих клеток».
